Per garantire il rispetto delle norme che regolano l'agricoltura biologica, esistono degli organismi di certificazione, autorizzati dal Ministero delle Politiche Agricole, Alimentari e Forestali. In Italia il loro accreditamento avviene sulla base della rispondenza ai criteri di indipendenza, imparzialità, efficacia, competenza ed affidabilità. Questi i principali: